Pemupukan berimbang adalah kunci hasil panen yang maksimal. Untuk lahan padi seluas satu hektar, kebutuhan pupuk dapat dihitung dari hasil analisis tanah atau rekomendasi setempat. Umumnya petani menggunakan pupuk nitrogen, fosfor dan kalium dengan komposisi yang disesuaikan fase pertumbuhan. Pada fase awal tanaman membutuhkan nitrogen lebih banyak untuk pembentukan anakan. Pada fase generatif, kalium berperan penting untuk pengisian bulir. Aplikasi pupuk sebaiknya dilakukan saat tanah dalam kondisi lembap, tidak tergenang penuh, dan tidak tepat setelah hujan deras agar unsur hara tidak hilang terbawa air. Dengan perhitungan yang tepat, biaya pemupukan dapat ditekan hingga dua puluh persen tanpa menurunkan hasil panen.
